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ここでは、 長崎県水産試験場が明治33年に創立されて以来、現在までの調査船をご紹介します。
※トン数は、鶴丸（3代目）以外は旧測度法によるものです。
飛龍丸（ひりゅうまる）
【 明治 40 〜 大正 11 】
35トン 木造帆船
長洋丸（ちょうようまる）
【大正 11 〜 昭和 6 】
51.54トン スクーナー型木造帆船
片手廻巾着網漁船として建造。昭和2年に漁業調査船に改造。
昭和6年9月12日、大瀬崎（玉之浦町）沖合南西200海里付近にて暴風のため沈没。（乗員15名のうち13名殉職）
鴎丸（かもめまる）
（初代）
【大正 15 〜 ？ 】
10.9トン 木船
鶴丸（つるまる）
（初代）
【昭和 8 〜 43 】
122.31トン スクーナー型鋼帆船。
戦時中は徴用により北方戦線に従軍。兵装解除後、復帰。
何度も改装をおこない、最終的には400PSのディーゼルエンジンに換装。
鴎丸（かもめまる）
（２代目？）
【昭和 9 〜 ？ 】
14トン 木船
みやこ丸
【昭和 25 〜 37 】
23.86トン 鋼船。
もと海軍沿岸警備艇を購入。
みさご丸
【昭和 26 〜 30 】
10.54トン 木船。
昭和30年8月の台風9号で破損。
かもめ丸
【昭和 28 〜 35 】
1.48トン 木船。
わかづる
（初代）
【昭和 37 〜 56 】
25.16トン 綱船。
ともづる
（初代）
【昭和 37 〜 48 】
17.58トン 木船。
鶴丸（つるまる）
（２代目）
【昭和 43 〜 60 】
154.17トン 綱船。
ともづる
（２代目）
【昭和 48 〜 54 】
14.92トン ＦＲＰ船。
ともづる
（３代目）
【昭和 54 〜 60 】
19.90トン ＦＲＰ船。
わかづる
（２代目）
【昭和 56 〜 平成 13 】
19.98トン ＦＲＰ船。
これら調査船以外に「あさづる」「いそづる」「対馬」「ひなづる」「はくつる」などの作業船等がありました。
調査船鶴丸
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調査指導船ゆめとび
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